南京显微镜是用于研究所谓透明与不透明各向异性材料的一种显微镜。凡具有双折射的物质，在偏光显微镜下就能分辨的清楚，当然这些物质也可用染色法来进行观察，但有些则不可能，而必须利用偏光显微镜。反射偏光显微镜是利用光的偏振特性对具有双折射性物质进行研究鉴定的仪器，可供广大用户做单偏光观察，正交偏光观察，锥光观察。
南京显微镜的调节与校正：
1.选择并装配物镜和目镜：按需要选择物镜和目镜，在安装目镜时注意其内十字丝的方向。
2.调节照明：打开光源灯，调节变压器旋扭，直到亮度适度为止。
3.焦准：将薄片置于物台上，在教师指导下，用粗调或微调调焦至物象清晰。在此过程中，千万注意，物镜前透镜不要与薄片接触，以免打碎薄片或损坏镜头。
4.物镜中心的校正：物台旋转轴、物镜中轴、镜筒中轴、目镜中轴必须保持在一条直线上，偏光显微镜才能正常使用，目前有关物镜中心的校正将由指导教师来完成。
5.下偏光镜的检查：下偏光镜的振动为东西向。当黑云母的解理平行下偏光镜的振动方向时颜色最深，据此可以检查、调节下偏光镜的振动方向。
6.上偏光镜的检查：移去薄片，视域黑暗，说明上偏光振动方向与下偏光振动方向互相垂直。否则，需要进行调节。
南京显微镜的应用：
1.生物领域：在生物体中，不同的纤维蛋白结构显示出明显的各向异性，使用偏光显微镜得到这些纤维中分子排列的详细情况。如胶原蛋白、细胞分裂时的纺缍丝等。
2.各种生物和非生物材料鉴定：如淀粉性质鉴定、药品成分鉴定、液晶、顿狈础晶体等。
3.地矿分析：如种矿物及结晶体的分析。
4.医学分析：如结石、尿酸晶体检测、关节炎等。
5.材料显微组织的各项同性和异性等。
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